冷凍式干燥機應安裝在環境溫度為2-45℃，四周通風良好，空氣潔凈的建筑物內；特別是避免空氣中含有腐蝕類成份（如氨）。當室內機房通風條件不良時，需在機房內安裝換氣排風設備。
冷干機與空壓機之間至少有4-5米的距離，以防止空壓機產生的振動影響冷干機正常運行。
風冷型冷干機的進風口與墻體距離1.5m以上，兩臺干燥機的進風口與排風口不能面對面。冷干機四周應留有一定的空間，以方便維修和日常維護。
水冷式超低溫真空冷凍干燥機對環境溫度不敏感，不過它對冷卻水的要求更高，但水冷式的安裝較風冷式復雜；凍干機起源于19世紀20年代的真空冷凍干燥技術經歷了幾十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了長足進展。主機與真空泵之間由真空管連接，連接處采用卡箍。卡箍內含一只密封橡膠圈，連接前可在橡膠圈上涂抹適量真空脂，再用卡箍卡緊。
與水冷式超低溫真空冷凍干燥機相比，風冷式超低溫真空冷凍干燥機對環境要求較高，但安裝方便、使用簡單。凍干機起源于19世紀20年代的真空冷凍干燥技術經歷了幾十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了長足進展。但是也有一部分水霧在經過過濾器時被集中和除去。冷凍干燥機過濾器的主要作用是過濾壓縮空氣中的固體顆粒。
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